Pada 6 September 2010, Gunawan (51 tahun) meninggal dunia di pejabatnya di bangunan Dato’ Jaafar Muhammad, Kota Iskandar Nusajaya selepas mengadu sakit dada. Beliau mengidap diabetes sejak beberapa lama. Jenazah dihantar ke Hospital Sultanah Aminah, Johor Baharu untuk dibedah siasat dan kes diklasifikasikan sebagai mati mengejut.[3] Jenazah dikebumikan di tempat kelahirannya di tanah perkuburan Felda Ulu Tebrau.